Photo Credit:Edward JennerPhoto Credit:Edward Jenner
在生物環境研究中,eDNA 讓研究者透過收集生態環境裡的微小線索,利用環境樣本中的生物殘留物,進行物種辨識和生態監測,大幅提升了效率和準確性,現在更有企業以 eDNA 技術為基礎,開發出相關服務!
社企流/編譯:陳軍鈞
推理、懸疑、犯罪類型的作品總是十分受歡迎,在台灣大家最熟悉的推理作品《名偵探柯南》今年恰逢連載 30 週年,日本各地正在舉行巡迴紀念展呢!在這類型作品中,作為偵辦方的主角如何抽絲剝繭、從遺落在現場的小細節推敲出兇手的過程,是最令人期待的環節,而在生物環境的研究中,也有一種正在蓬勃發展的技術與方法,讓研究者藉此收集微小的線索來推論生態環境的情況——eDNA(environmental DNA,也稱作環境 DNA)指的是從環境樣本中收集生物殘留物而獲得的 DNA 混合體。

以小窺大,從環境樣本獲取生態資訊的 eDNA

環境樣本可以包含土壤、空氣、水、底質沉積物、糞便、尿液、動物胃袋中未消化完全的食糜等,而在這些環境樣本中可能可以採集到微生物、植物體或是動物的皮膚、口水、黏膜等,便可以從中獲得需要的生物體 DNA。搭配 DNA 定序技術的發展,藉由這樣的 eDNA 便能進行物種辨識,累積基因組資料庫,並進一步將此作為生物普查及生態監測的工具。傳統的物種普查方法多是以目視、陷阱捕捉、回放調查或野外監測的自動相機來進行;然而有了 eDNA,則可以取樣水塘中的水,便能得知水塘中有哪些生物以外,可能還能夠知道有哪些動物會前來水塘喝水,透過取樣就能夠獲得生態環境的相關資訊,相較於傳統的調查方法,節省了大量的人力與時間,這便是 eDNA 的主要貢獻。
(採集河水樣本,藉助 eDNA 方法比起傳統調查方法能大幅節省人力與時間成本。來源:aleksandarlittlewolf on Freepik)
(採集河水樣本,藉助 eDNA 方法比起傳統調查方法能大幅節省人力與時間成本。來源:aleksandarlittlewolf on Freepik
面對全球氣候與環境的急遽變動,生物多樣性的監測與保育工作顯得更加重要,eDNA 除了讓生物普查工作的效率大幅提升外,也有助於掌握不同物種個體的活動範圍與時空分布,同時也有助於辨識外來種的入侵。例如 2014 年的法國科學家與 2017 年的加拿大科學家,都曾收集有北極熊足跡的雪樣本,並找到北極熊腳掌的皮膚細胞,並利用 eDNA 的技術來萃取北極熊的 DNA 進行後續研究。海水中的 eNDA 則能了解海洋生物多樣性、協助進行鯨豚監測、調查瀕危物種,還能用以推估全球暖化議題造成的氣候變遷對海洋生物的可能衝擊。

從大眾教育到商業開發,從淺到深的 eDNA 應用管道

eDNA 最早是應用於考古學遺址的生態研究,而現在除了研究室中的各種科學研究,eDNA 也能運用於大眾教育與創新商業的領域。由於 eDNA 的樣本收集與測試步驟相對簡單,有些實驗室或科學教育推廣單位便和學校、社區合作,由學生或居民來參與環境監測,除了協助科學研究外,也讓民眾透過實作親身感受到自然環境的變化,並為此付出努力。
除了大眾教育的面向,eDNA 的技術應用正在推動環境產業的發展。為什麼作為生物調查方法,eDNA 能夠具備商業發展的潛力呢?如同前面所提到,eDNA 的樣本收集與測試步驟相對簡單,但能應用的範圍卻很廣,例如離岸風電與石油探勘業者對深海區域其實有開發興趣,但這個區域要進行環境評估的相關調查是相對困難的,利用 eDNA 的技術可能就可以用相對低廉的成本來進行,並協助產業發展。
美國公司 Best Bees 創立於 2010 年,以提供城市裡的住宅與公司養蜂服務為主要營業項目,他們運用蜂蜜中的 eDNA 蒐集環境資訊,讓顧客了解其所在的位置與蜜源植物之間的環境關係,這在強調企業環境保護責任的當代,成為一門越來越受到重視的生意;除此之外,Best Bees 也運用這項技術,協助以生產蜂蜜為主的企業,以科學方法證明其蜂蜜的品質與純度,增加生產履歷的項目並提升可信度。
(美國 Best Bees 運用 eDNA 協助客戶在城市裡養蜂,協助販售蜂蜜的客戶提升商品價值。來源:İbrahim Özdemir on Unsplash)
(美國 Best Bees 運用 eDNA 協助客戶在城市裡養蜂,協助販售蜂蜜的客戶提升商品價值。來源:İbrahim Özdemir on Unsplash
微小卻重要,看似簡單背後卻隱藏了複雜的生態環境與科學原理,這便是 eDNA 的魅力與重要性所在之處。
參考資料
核稿編輯:葉于甄
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